La paroisse de Chantonnay (Canto Agnetis) existe depuis le XIIème siècle. L’église, pillée pendant la guerre de Cent Ans, fut reconstruite par Nicolas des Nouhes seigneur du Pally en 1460. Durant les guerres de Vendée, l’édifice, incendiée fut relativement épargné en servant d’entrepôt aux troupes républicaines. En 1856, le curé Georges du Tressay charge l’architecte Léon Ballereau de reconstruire l’église. Ne gardant que la base du clocher du XIIème siècle et le choeur du XVème siècle, il édifie une construction néo-gothique rectangulaire en ajoutant un bas-côté en prolongation de la tour du clocher. La façade, de type poitevin, comporte trois portails, une rosace encadrée de deux verrières et trois niches pourvues de statues. Les vitraux du chevet plat sont réalisés en 1857 par le maître-verrier chantonaisien Guérithault et, pour des raisons financières, la flèche du clocher, culminant à 52 mètres, ne sera édifiée qu’en 1861. Une élégante tribune destinée à recevoir l’orgue sera construite dans la nef par l’architecte Joseph Libaudière en 1893. Récemment a été posé un vitrail signé Dominique Landucci et relatant l’incendie de l’église en 1793.
